人體有些地方是不能有任何細菌的,如血液、骨髓內,但有些器官卻必須有細菌存在,如腸腔、皮膚、口腔等。當然,這些細菌是不具有通常的致病性質的。

  大腸中有許多細菌。細菌中含有的酶,能使食物殘渣和植物纖維分解。其中有益物質由腸壁吸收,有害物質則呈大便形式排出體外。大腸內細菌還能利用腸內較簡單的物質,合成複合維生素B和維生素K,它們由腸壁吸收後對人體具有營養作用和凝血功能。據估計,糞便中死的和活的細菌約占糞便固體總量的20%~30%。腸道內正常生長的細菌還有抑制致病微生物的作用。有些長壽老人,由於膳食結構的關係,他們大腸中的正常寄生菌較多,因而致病菌較少。學者解釋這種情況是長壽的重要因素之一。『酸牛奶和乳酶之所以有益於健康,原因就在於其中的乳酸桿菌可以抑制致病菌的生長和繁殖。不適當地使用抗生素,會大量殺滅腸道內正常的寄生菌,其後果往往會導致真菌性腸炎,原因便是腸道菌叢的改變。

  正常皮膚表面寄生的細菌有小球菌、棒狀桿菌、糠秕孢子菌等,它們可將皮脂分解成游離脂肪酸,對皮膚表面的致病菌有抑制作用。